Browsing by Author "Fainburg, Leandro A."

Now showing 1 - 2 of 2
  • No Thumbnail Available
    Item
    Análisis de la estructura poblacional y variabilidad genética de la caballa (Scomber colias, Gmelin 1789) del Mar Argentino
    (Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero (INIDEP), 2024) Fainburg, Leandro A.; Salomone, Andrea L.; Buratti, Claudio C.; Trucco, María Inés
    Con el objetivo de caracterizar la estructura y dinámica poblacional de la caballa en el Mar Argentino, se analizó la distribución espacial y temporal de la diversidad genética mediante marcadores ISSRs. Se analizaron muestras colectadas en proximidad de Mar del Plata (2010, 2011, 2013 y 2014), en el área denominada El Rincón (2010, 2011 y 2014) así como en aguas de Patagonia (2013 y 2014). Además, por primera vez, se analizaron individuos juveniles provenientes de Mar del Plata (2013 y 2014) y El Rincón (2014). Todas las muestras presentaron altos grados de variabilidad genética, no hallándose bandas fijadas localmente. Se detectó una subdivisión poblacional elevada entre Provincia de Buenos Aires y Patagonia. En cambio, los dos stocks pesqueros del Norte (Mar del Plata) y Sur (El Rincón) mostraron una diferenciación genética leve a moderada. El análisis de los individuos juveniles del Norte y Sur, mostró una menor diferenciación genética entre ellos, que la hallada entre los adultos. Asimismo, las diferencias interanuales halladas para un mismo sitio de muestreo fueron moderadas, lo que podría deberse a una dinámica poblacional de bajo flujo génico, lo que mantendría la estructura genética en el tiempo. Estudios involucrando otras metodologías (microquímica del otolito, análisis de caracteres merísticos y morfométricos, ensambles de parásitos) que permitan integrar los resultados en un enfoque holístico serán propicios para caracterizar la estructura y dinámica poblacional de la caballa en aguas del Mar Argentino.
  • No Thumbnail Available
    Item
    Obtención de marcadores genómicos (SNPs) en tres especies de interés comercial del Atlántico Sudoccidental mediante tecnología de secuenciación masiva
    (Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero (INIDEP), 2025) Fainburg, Leandro A.; Rodríguez Golpe, Daniela C.; Andreoli, Gabriela; Rico, María Rita; Riestra, Cecilia M.; Prandoni, Nicolás I.; Trucco, María Inés
    La técnica de secuenciación masiva RAD-seq se basa en ADN asociado a sitios de restricción y se utiliza para estudios genómicos poblacionales. En este trabajo se obtuvieron polimorfismos de nucleótido simple (SNPs) en tres especies de interés comercial del Atlántico Sudoccidental: corvina rubia (Micropogonias furnieri), pez palo (Percophis brasiliensis) y calamar argentino (Illex argentinus) mediante análisis bioinformático de secuencias RAD-seq. Para ello, se realizó la extracción del ADN genómico, el ensamblado de una biblioteca de ADN asociado a sitios de restricción, la secuenciación masiva de alto rendimiento y el análisis bioinformático de los datos resultantes. Para la obtención e identificación de los SNPs, se empleó un pipeline bioinformático (serie de algoritmos ejecutados en orden) que permitió el ensamblado de novo del genoma de cada especie. Los resultados mostraron una elevada cantidad de loci polimórficos en las dos especies de peces: más de 25.000 SNPs en pez palo y más de 15.000 en corvina rubia. Por el contrario, en el calamar el número de SNPs obtenidos fue reducido. El nivel de resolución alcanzado en las especies de peces estudiadas permitirá desarrollar estudios de dinámica poblacional con un alto grado de resolución. En cambio, los resultados obtenidos para calamar sugieren la necesidad de reevaluar y optimizar la metodología empleada, antes de llevar a cabo estudios poblacionales a gran escala para esta especie.