Obtención de marcadores genómicos (SNPs) en tres especies de interés comercial del Atlántico Sudoccidental mediante tecnología de secuenciación masiva
| dc.contributor.author | Fainburg, Leandro A. | |
| dc.contributor.author | Rodríguez Golpe, Daniela C. | |
| dc.contributor.author | Andreoli, Gabriela | |
| dc.contributor.author | Rico, María Rita | |
| dc.contributor.author | Riestra, Cecilia M. | |
| dc.contributor.author | Prandoni, Nicolás I. | |
| dc.contributor.author | Trucco, María Inés | |
| dc.date.accessioned | 2026-07-02T13:42:29Z | |
| dc.date.available | 2026-07-02T13:42:29Z | |
| dc.date.issued | 2025 | |
| dc.description.abstract | La técnica de secuenciación masiva RAD-seq se basa en ADN asociado a sitios de restricción y se utiliza para estudios genómicos poblacionales. En este trabajo se obtuvieron polimorfismos de nucleótido simple (SNPs) en tres especies de interés comercial del Atlántico Sudoccidental: corvina rubia (Micropogonias furnieri), pez palo (Percophis brasiliensis) y calamar argentino (Illex argentinus) mediante análisis bioinformático de secuencias RAD-seq. Para ello, se realizó la extracción del ADN genómico, el ensamblado de una biblioteca de ADN asociado a sitios de restricción, la secuenciación masiva de alto rendimiento y el análisis bioinformático de los datos resultantes. Para la obtención e identificación de los SNPs, se empleó un pipeline bioinformático (serie de algoritmos ejecutados en orden) que permitió el ensamblado de novo del genoma de cada especie. Los resultados mostraron una elevada cantidad de loci polimórficos en las dos especies de peces: más de 25.000 SNPs en pez palo y más de 15.000 en corvina rubia. Por el contrario, en el calamar el número de SNPs obtenidos fue reducido. El nivel de resolución alcanzado en las especies de peces estudiadas permitirá desarrollar estudios de dinámica poblacional con un alto grado de resolución. En cambio, los resultados obtenidos para calamar sugieren la necesidad de reevaluar y optimizar la metodología empleada, antes de llevar a cabo estudios poblacionales a gran escala para esta especie. | |
| dc.identifier.citation | Fainburg, L.A.; Rodríguez Golpe, D.A.; Andreoli, G.; Rico, M.R.; Riestra, C.M.; Prandoni, N.I.; Trucco, M.I. (2025). Obtención de marcadores genómicos (SNPs) en tres especies de interés comercial del Atlántico Sudoccidental mediante tecnología de secuenciación masiva (Informe de Investigación, No. 93). Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero (INIDEP) | |
| dc.identifier.uri | https://marabierto.inidep.edu.ar/handle/inidep/5391 | |
| dc.language.iso | es | |
| dc.publisher | Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero (INIDEP) | |
| dc.relation.ispartofseries | Informe de Investigación; 93 | |
| dc.title | Obtención de marcadores genómicos (SNPs) en tres especies de interés comercial del Atlántico Sudoccidental mediante tecnología de secuenciación masiva | |
| dc.type | Technical Report |