Amplificación de un gen mitocondrial (D-loop) Para el estudio de filopatría en Mustelus schmitti
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Date
2017
Authors
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Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero (INIDEP)
Abstract
Tanto el comportamiento reproductivo como la conectividad son parámetros importantes en la dinámica poblacional y están estrechamente relacionados con la estructura genético poblacional. Para evaluar la filopatría o tendencia a regresar al sitio de nacimiento para la reproducción en el gatuzo, se diseñaron cebadores para amplificar el gen D-loop, que es muy utilizado en peces. Este gen mitocondrial que posee tamaño variable es muy utilizado ya que carece de ADN repetitivo, no se recombina, muestra altos niveles de variabilidad intraespecífica y tiene una alta tasa mutacional. Se seleccionaron 13 secuencias del género Mustelus del Genbank de diferentes especies, se realizó un alineamiento múltiple y se obtuvieron los cebadores sentido y antisentido. Mediante un análisis de BLAST se corroboró que fueran idóneos para la amplificación y no se combinen en otra región. Se establecieron las condiciones más efectivas para la amplificación del gen D-loop, obteniendo una banda de 1300pb aproximadamente de buena intensidad que permita purificar y secuenciar dicho gen. El diseño de este cebador no se había realizado hasta el momento en Mustelus schmitti y el gen D-loop servirá como nuevo marcador molecular para estudios poblacionales, de filogeografía y para evaluar filopatría reproductiva.
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Citation
Andreoli, G.; Trucco, M.I. (2017). Amplificación de un gen mitocondrial (D-loop) Para el estudio de filopatría en Mustelus schmitti (Informe de Investigación, No. 6). Instituto Nacional de Investigación y Desarrollo Pesquero (INIDEP)